В 2005 году на финансирование природоохранных мероприятий "Сургутнефтегаз" планирует направить не менее восемь миллиардов 200 миллионов рублей. В 2004 году подобные мероприятия потребовали от Сургутнефтегаза затрат в сумме более семи миллиардов рублей. Ведомственный экологический мониторинг качества вод и почв, состояния атмосферного воздуха, а также источников выбросов, сбросов и полигонов отходов в Сургутнефтегазе осуществляют девять лабораторий.
Под пристальным вниманием и контролем сотрудников лаборатории находится 73 реки и десять озер. Кроме этого определяется фоновое состояние и на вновь вводимых месторождениях в 171 точке, в 56 точках контролируются грунты и грунтовые воды, состояние атмосферного воздуха контролируется на месторождениях компании в 44 точках, снежного покрова в 29 точках.