Авария в районе Капотни тревожит всех жителей Москвы как с неудобствами, связанными с отключением света и воды, так и загрязнением атмосферного воздуха. По сведениям Московского Центра по гидрометеорологии и мониторинга окружающей среды экстремально высокого загрязнения воздуха в городе не наблюдалось. Хотя в период аварии в регионе сложились неблагоприятные метеорологические условия (слабый ветер южного направления, задерживающие слои инверсии температуры), способствующие накоплению вредных примесей в приземном слое. На этот период Московский центр давал предупреждения на сокращение выбросов на 15-20% с 15 часов 23.05 до 15 часов 24.05 и на 20-40% последующие сутки с 15 часов 24.05 до 15 часов 25.05. В связи с прекращением энергоснабжения МНПЗ производил выбросы технологической смеси, которая сгорала при температуре выше 1000°С. Через пробитую в инверсии брешь, основное количество загрязняющих веществ ушло в средние слои тропосферы, что помогло избежать экстремально высокого загрязнения в приземном слое. По данным наблюдений на стационарных постах, где проводились учащенные наблюдения (каждые 3 часа) - в Братеево, Печатниках и Орехово-Борисово, максимальная концентрация оксида углерода, в период аварии, в 7 ч. 25.05 превысила норму в 2 раза, диоксида азота – в 3,5 раза, углеводорода – в 2 раза. По наблюдениям за 19 ч. 25.05, 01 и 07 ч. 26.05 концентрации всех примесей находились в пределах нормы. Этому способствовали, как проводимые в городе мероприятия по ликвидации последствий аварии, так и погодные условия, которые сменились на благоприятные для рассеивания примесей. Ветер сменил направление на северо-западное и усилился до 3-5 м/с, разрушилась инверсия температуры, поступила свежая воздушная масса.