Как видно из установленных судом обстоятельств дела, на основании заключения от 22.03.2004 № 794 инспекция налоговой службы самостоятельно произвела перечисление денежных средств с переплаты по НДС в счет погашения задолженности по пене, начисленной унитарному предприятию за несвоевременное перечисление платы за негативное воздействие на окружающую среду. Общая сумма указанной пени, начисленной за период 2002 - 2003 годы, составила 918668,74 руб.
07.06.2005 унитарное предприятие обратилось в налоговый орган с заявлением и письмом о возврате 918668,74 руб. переплаты по НДС на том основании, что налоговым органом неправомерно произведено перезачисление денежных средств с переплаты по НДС в счет погашения задолженности по пене, начисленной за несвоевременное перечисление платы за негативное воздействие на окружающую среду.